Η μελέτη της Διεύθυνσης Αναστήλωσης Βυζαντινών και Μεταβυζαντινών Μνημείων που παρουσιάστηκε στο Κεντρικό Αρχαιολογικό Συμβούλιο και έλαβε θετική γνωμοδότηση, προβλέπει, ότι οι πτέρυγες των κελιών θα διατηρήσουν μικρό ποσοστό της αρχικής τους μορφής των μεταβυζαντινών χρόνων, αφού το κύριο μέρος της ανοικοδόμησής τους έγινε κατά τους δύο τελευταίους αιώνες. Αποτελούν σημαντικό στοιχείο της αρχιτεκτονικής ιστορίας του μνημείου (το οποίο αποτελεί ένα πραγματικό «κοκτέιλ» αρχιτεκτονικών επιρροών από διάφορες εποχές), ενώ είναι και τα μοναδικά κτίσματα που μπορούν να στεγάσουν εργασίες και προγράμματα που γίνονται στους αρχαιολογικούς χώρους. Ο προϋπολογισμός αυτού του πρώτου σωστικού βήματος ανέρχεται στα 350 εκατομμύρια δραχμές.