Σε δύσκολη θέση έχουν περιέλθει και οι ελεγκτές του ΟΠΕΚΕΠΕ, εξαιτίας της Κοινής Υπουργικής Απόφασης της 21ης του Φλεβάρη, η οποία, μεταξύ άλλων, περιορίζει χρονικά τη λειτουργία των ελαιοτριβείων. Σε έγγραφο που έστειλαν προς τον προϊστάμενο του Οργανισμού, οι ελεγκτές από την Αργολίδα, την Αχαΐα, τη Ζάκυνθο, την Κέρκυρα, την Κορινθία και τη Φωκίδα, κάνουν λόγο για «παρεμπόδιση του ελεγκτικού έργου, λόγω έλλειψης σαφών και συγκεκριμένων οδηγιών, που αντιφάσκουν μεταξύ τους, και έχουν ως συνέπεια τις αλλεπάλληλες αλλαγές του τρόπου ενέργειας του ελέγχου». Ακόμη, επισημαίνουν τη δυσχερή θέση στην οποία βρίσκονται, «αφού τίθενται σε αντιπαράθεση με τους ελεγχόμενους και εξοργισμένους παραγωγούς και ελαιοτριβείς. Ταυτοχρόνως, παρεμποδίζεται η ορθή και ομαλή διεξαγωγή των ελέγχων, και προάγονται η δυσαρέσκεια και η δυσπιστία των ελεγχόμενων προς τους ελεγκτές».

Επίσης, σε ανάλογη ανακοίνωση του Πανελλήνιου Συλλόγου Εργαζομένων στον ΟΠΕΚΕΠΕ σημειώνεται ότι «η κατάσταση που έχει διαμορφωθεί στο ελαιόλαδο έχει φθάσει στο απροχώρητο. Η ασάφεια των οδηγιών, οι αντικρουόμενες οδηγίες, οι προφορικές παρεμβάσεις και η έκδηλη ανικανότητα οργάνωσης κινδυνεύουν να στραφούν σε βάρος των ελεγκτών, αφήνοντας τους εκτεθειμένους από τη μια στην πίεση των παραγωγών που έχουν ανάγκη να ελαιοποιήσουν και από την άλλη στην απαγόρευση που έχει επιβάλει η γνωστή ΚΥΑ».