Η έλλειψη οξυγόνου μέσα στο νερό της λίμνης Κορώνειας και η μικρή ποσότητα νερού μέσα στη λεκάνη απορροής, ευνόησαν τη δημιουργία της τοξίνης της αλλαντίασης, από την οποία μολύνθηκαν και πέθαναν, το τελευταίο διάστημα, ψάρια και χιλιάδες πουλιά που έβρισκαν καταφύγιο στη λίμνη. Τα παραπάνω προκύπτουν από τις τοξικολογικές εξετάσεις που έγιναν σε εργαστήρια της Ελλάδας και Αγγλίας, σε δείγματα που περισυνελέγησαν από την «άρρωστη» λίμνη.

H αλλαντίαση είναι μια μορφή δηλητηρίασης που μπορεί να προέκυψε από την κατανάλωση ακατάλληλης τροφής, όπως σκουλήκια ή σάπια οργανική ύλη που υπάρχει στο βυθό, ή ακόμη μπορεί να αναπτύχθηκε στο αναερόβιο περιβάλλον της λίμνης. Ωστόσο, όπως τονίζεται από τους υπεύθυνους του Κέντρου Κτηνιατρικών Ιδρυμάτων Θεσσαλονίκης, λόγω της μικρής ποσότητας ορού που εστάλη στα εργαστήρια δεν έχει γίνει ακόμη γνωστός ο τύπος της τοξίνης που προκάλεσε το πρόβλημα.