Ακόμη και η κυβέρνηση αναγκάστηκε να παραδεχτεί σημαντικές παραβάσεις της εταιρίας
Από τα σχετικά στοιχεία για τη δράση του «Νηογνώμονα», αξίζει να σημειώσουμε αυτό το οποίο επιβεβαιώνεται και από την κυβέρνηση. Συγκεκριμένα, στις 13 Αυγούστου 1997, ο τότε υφυπουργός Οικονομικών Γιώργος Δρυς, απαντώντας σε Ερώτηση των βουλευτών του ΚΚΕ Στρατή Κόρακα και Νίκου Γκατζή, σχετική με τους φορολογικούς ελέγχους, που είχαν διενεργηθεί στον «Ελληνικό Νηογνώμονα», είχε επισημάνει: «Στην παραπάνω επιχείρηση διενεργήθηκε στις 28.3.95 προληπτικός έλεγχος από την ΥΠΕΔΑ Αθηνών από κοινού και με την Τελωνειακή Διεύθυνση Ελέγχου Οικονομικού Εγκλήματος. Από τον έλεγχο αυτό προέκυψαν παραβάσεις για τις οποίες ήδη έχουν επιβληθεί τα οικεία πρόστιμα από την αρμόδια ΔΟΥ, ενώ βρέθηκαν και κατασχέθηκαν και διάφορα ανεπίσημα στοιχεία, που στη συνέχεια διαβιβάστηκαν στη ΔΟΥ για επεξεργασία και περαιτέρω αξιοποίηση. Ηδη, από την αρμόδια ΔΟΥ έχει αρχίσει η επεξεργασία των πιο πάνω κατασχεθέντων στοιχείων, για τη χρήση '93 και '94, στα πλαίσια τακτικού ελέγχου, αλλά και σε σχέση με περαιτέρω προγενέστερες χρήσεις με τις οποίες εμπλέκονται».
Να αναφέρουμε, επίσης, ορισμένες από τις κατηγορίες, που απήγγειλε με το κατηγορητήριό της - καταπέλτη η 4η ανακρίτρια Πειραιά Μαριάνθη Παγουτέλη για το ναυάγιο του ΔΥΣΤΟΣ. Η ανακρίτρια κατηγόρησε τον τότε πρόεδρο του «Ελληνικού Νηογνώμονα» και σημερινό μέλος της διοίκησης Τριαντάφυλλο Λυσιμάχου και τον γενικό τεχνικό διευθυντή του Διονύση Μελισσηνό για έκδοση ψευδών βεβαιώσεων, πρόκληση ναυαγίου, ανθρωποκτονία κατά συρροή και ότι οι δύο «ενεργώντας από κοινού με πρόθεση εκτέλεσαν περισσότερα από ένα εγκλήματα, με σκοπό το αθέμιτο όφελος»!