Μόνο για λίγους μήνες από το 1998 διατέλεσε γενικός διευθυντής Αρχαιοτήτων ο πρώην προϊστάμενος της Διεύθυνσης Προϊστορικών και Κλασικών Αρχαιοτήτων (ΔΙΠΚΑ), Γιάννης Τζεδάκις.Το 1999 τον βρίσκει να αποχωρεί συνταξιοδοτούμενος, αφού το Υπουργικό Συμβούλιο αρνείται πλέον να συζητάει την παραμονή στην Υπηρεσία πέραν του ορίου συνταξιοδότησης.

Με απόφαση του υπουργού Πολιτισμού ο Γ. Τζεδάκις τοποθετείται διευθύνων σύμβουλος της Ανώνυμης Εταιρείας για την Προώθηση και Προβολή της Πολιτιστικής Κληρονομιάς. Ετσι η Αρχαιολογική Υπηρεσία χάνει ένα πολύτιμο, εδώ και 35 χρόνια, στέλεχός της, ενώ παραμένουν κενές τόσο η θέση του γενικού διευθυντή Αρχαιοτήτων όσο κι εκείνη του προϊσταμένου της ΔΙΠΚΑ.

Το ίδιο συνέβη και με τον γενικό διευθυντή Πολιτιστικής Ανάπτυξης, Σπύρο Ρέπουλη,ο οποίος θα αξιοποιηθεί σε επιτροπές και αποστολές στο εξωτερικό.