Αν και πέρασαν οκτώ χρόνια από το ναυάγιο του «Εξπρές Σαμίνα», η υπόθεση ακόμη σέρνεται στα δικαστήρια, παρά τις διαβεβαιώσεις της τότε ηγεσίας του υπουργείου Δικαιοσύνης ότι η δίκη θα γινόταν με εξπρές διαδικασίες. Το Ποινικό Τμήμα του Αρείου Πάγου, με την υπ' αριθμό 1530/2008 απόφασή του, επικύρωσε τις ποινές του Πενταμελούς Εφετείου Πειραιά που είχαν επιβληθεί σε οκτώ άτομα και απέρριψε την αίτηση αναίρεσης καταδικασθέντων, αφού οι αρεοπαγίτες έκριναν ότι η απόφαση έχει ειδική και εμπεριστατωμένη αιτιολογία.

Ωστόσο, η αρεοπαγίτικη απόφαση αφήνει ανοιχτό κάποιο παράθυρο για τον πλοίαρχο Β. Γιαννακή και τον υποπλοίαρχο Α. Ψυχογιό για να «πέσουν ακόμη πιο μαλακά», καθώς παρέπεμψε στην Ολομέλεια για να κριθεί ως ζήτημα γενικότερου ενδιαφέροντος, αν υπάρχει «πραγματική συρροή εγκλημάτων», όπως δέχτηκε η εφετειακή απόφαση, ή «φαινομενική συρροή», όπως ισχυρίζονται ο πλοίαρχος και υποπλοίαρχος, με αποτέλεσμα τα εγκλήματα της ανθρωποκτονίας από αμέλεια και σωματικών βλαβών από αμέλεια να απορροφούνται από το βασικό έγκλημα της διατάραξης της ασφάλειας της υδάτινης συγκοινωνίας με ενδεχόμενο δόλο.

Υπενθυμίζεται ότι από το Πενταμελές Εφετείο Πειραιά έχουν καταδικαστεί ο πλοίαρχος Β. Γιαννακής σε κάθειρξη 12 χρόνων, ο υποπλοίαρχος Α. Ψυχογιός σε κάθειρξη 12 χρόνων και 10 μηνών, ο πρώτος μηχανικός Γ. Σκιαδαρέσης σε κάθειρξη 7,5 χρόνων, ο ύπαρχος Γ. Τριαντάφυλλος σε φυλάκιση πέντε χρόνων (εξαγοράσιμη). Στα μαλακά έπεσαν οι πλοιοκτήτες της «MINOAN FLYING DOLPHINS» Κ. Κληρονόμος και Ν. Βικάτος, οι οποίοι τιμωρήθηκαν με ποινή φυλάκισης μόλις 2,5 χρόνων (εξαγοράσιμη). Από το ναυάγιο του «Εξπρές Σαμίνα», που προσάραξε στις 26 Σεπτέμβρη στη βραχονησίδα Πόρτες της Πάρου, έχασαν τη ζωή τους 80 άνθρωποι.