Νόμιμο κρίθηκε από το Ε' Τμήμα του Συμβουλίου Επικρατείας σχέδιο Προεδρικού Διατάγματος του ΥΠΕΧΩΔΕ, που αφορούσε την ενσωμάτωση στην ελληνική νομοθεσία της κοινοτικής οδηγίας 2004/35/ΕΚ. Το ΠΔ αφορά την ευθύνη για την πρόληψη και την αποκατάσταση των ζημιών στο περιβάλλον, με την οποία επιβάλλεται η αρχή «ο ρυπαίνων πληρώνει». Στην Οδηγία επαναλαμβάνονται ρητά (άρθρο 174) οι διεθνείς συμβάσεις, όπως του Λουγκάνο, η Διακήρυξη του Ρίο, η Συνθήκη της 22ας Σεπτέμβρη 1993 για το Περιβάλλον κ.ά. Για τη μη επικύρωση της Οδηγίας, η χώρα μας καταδικάστηκε στις 19 Μάη 2009 από το Δικαστήριο Ευρωπαϊκών Κοινοτήτων, καθώς θα έπρεπε να επικυρωθεί από το Μάη του 2007.

Να σημειωθεί ότι οι σύμβουλοι Επικρατείας κατά την επεξεργασία του ΠΔ κάνουν 30 επιμέρους παρατηρήσεις, οι κυριότερες από τις οποίες είναι: Εκριναν παράνομη διάταξη που επιτρέπει στο ΥΠΕΧΩΔΕ με απόφασή του να εντάσσει στο πεδίο εφαρμογής του Διατάγματος και νέες επαγγελματικές δραστηριότητες. Σύμφωνα με το ΣτΕ, η επέκταση αυτή πρέπει να γίνεται με Προεδρικό Διάταγμα. «Διαγραπτέα ως μη νόμιμη» κρίθηκε διάταξη που προβλέπει την απαλλαγή από την υποχρέωση αποκατάστασης της περιβαλλοντικής ζημιάς, σε περιπτώσεις που συγκεκριμένος όρος δημόσιας σύμβασης οδήγησε τον φορέα εκμετάλλευσης σε ενέργειες που δημιούργησαν ζημιά στο περιβάλλον.