Το προσωπικό του Λιμενικού Σώματος μπορεί να συμμετέχει σε σωματεία, συνδέσμους, ιδρύματα κλπ, που έχουν σκοπούς επιστημονικούς, μορφωτικούς και εκπολιτιστικούς, χωρίς την προηγούμενη έγκριση του αρχηγού του Λιμενικού Σώματος, σύμφωνα με απόφαση του Συμβουλίου της Επικρατείας (ΣτΕ).

Ειδικότερα, το ΣτΕ επεξεργαζόμενο σχέδιο Προεδρικού Διατάγματος (ΠΔ) για το πειθαρχικό δίκαιο, στην υπ' αριθμό 298/04 γνωμοδότησή του επισημαίνει ότι η παραπάνω διάταξη κατά το μέρος που εξαρτά το συνταγματικό δικαίωμα του συνεταιρίζεσθαι από προηγούμενη έγκριση του αρχηγού και καθιστά πειθαρχικά ελεγκτέα την παράλειψή της, προσκρούει στο άρθρο 12 του Συντάγματος, γιατί το δικαίωμα του συνεταιρίζεσθαι ασκείται χωρίς περιορισμούς ακόμη και στο στρατιωτικά οργανωμένο προσωπικό του Λιμενικού Σώματος και επομένως θα πρέπει να διαγραφεί η εν λόγω διάταξη από το σχέδιο ΠΔ.

Επίσης, το ΣτΕ προτείνει να διαγραφεί ή να αναδιατυπωθεί και η διάταξη που επιτρέπει στο ΥΕΝ και τον αρχηγό του Λιμενικού Σώματος μη νόμιμα την επιβολή πειθαρχικής ποινής, χωρίς να τηρηθεί η συνήθης διαδικασία, δηλαδή παραπομπή, αιτιολογία, τυχόν σύγκληση ανακριτικού συμβουλίου κλπ.