Πρόστιμα προς αγροτικούς συνεταιρισμούς και μεταποιητικές βιομηχανίες επέβαλε η Υπηρεσία Ειδικών Ελέγχων, αφού έπειτα από σχετικούς ελέγχους διαπιστώθηκε ότι εκδίδονταν τιμολόγια για ποσότητες βιομηχανικής τομάτας κατά πολύ μεγαλύτερες από αυτές που πραγματικά παραδίδονταν. Οι έλεγχοι πραγματοποιήθηκαν από την Επιχειρησιακή Διεύθυνση Ειδικών Υποθέσεων Θεσσαλονίκης, προφανώς σε συνεταιρισμούς και βιομηχανίες της Β. Ελλάδας, χωρίς ωστόσο να διευκρινίζονται παραπάνω στοιχεία.
Σύμφωνα με τη σχετική ανακοίνωση του υπουργείου Οικονομικών, από τους ελέγχους διαπιστώθηκαν εικονικές παραδόσεις, το ύψος των οποίων υπολογίστηκε σε 4.912,732 τόνους για το έτος 2000 και 24.179,774 τόνους για το έτος 2002. Η αξία των εκδοθέντων τιμολογίων που αντιστοιχεί στις εικονικές παραδόσεις, ανέρχεται σε 441.995 ευρώ για το έτος 2000 και σε 1.163.131 ευρώ για το 2002.
Στους συνεταιρισμούς επιβλήθηκαν πρόστιμα συνολικού ύψους 3.210.174 ευρώ, ενώ αντίστοιχα πρόστιμα «θα» επιβληθούν και στις βιομηχανίες - λήπτες των εικονικών και υπερτιμολογημένων στοιχείων. Η σχετική αναφορά στάλθηκε και στον ΟΠΕΚΕΠΕ προκειμένου να επιστραφούν οι επιδοτήσεις που είχαν εισπραχθεί για τις εικονικές ποσότητες.