Στις 5/8/97 οι βουλευτές του ΚΚΕ,Αχιλλέας Κανταρτζής και Βαγγέλης Μπούτας,θίγοντας σε Ερώτηση που κατέθεσαν προς τον υπουργό Πολιτισμού το όργιο λαθρανασκαφών στον αρχαιολογικό χώρο της Κοινότητας Γόμφων Τρικάλων,ζητούσαν απαντήσεις σχετικά με τι μέτρα θα ληφθούν ώστε: "Να προστατευτούν οι αρχαιολογικοί χώροι και να παταχτούν οι λαθρανασκαφές, να προστατευτούν τα ευρήματα και ο χώρος της ανασκαφής στην κοινότητα Γόμφων Τρικάλων και να διατεθεί το αναγκαίο προσωπικό και οι πιστώσεις, προκειμένου να ολοκληρωθούν οι ανασκαφές, να στελεχωθούν οι Εφορείες Αρχαιοτήτων του νομού με το αναγκαίο προσωπικό και να αρχίσουν άμεσα οι διαδικασίες για την ίδρυση του Αρχαιολογικού Μουσείου Τρικάλων".

Στα παραπάνω ερωτήματα ο υπουργός Πολιτισμού απαντά: "Η αρμόδια Εφορεία βρίσκεται σε συνεργασία με το δήμο, προκειμένου να βρεθεί οικόπεδο για την ανέγερση του Μουσείου",αλλά και ότι υπάρχει "επισκέψιμη αρχαιολογική συλλογή". Για τα υπόλοιπα παραπέμπει στο σημείωμα της ΙΓ' Εφορείας Προϊστορικών και Κλασικών Αρχαιοτήτων.

Η Εφορεία όμως λέει ότι "στο Δήμο Μουζακίου διατηρεί αποθήκη μεταφοράς και φύλαξης των αρχαιοτήτων".Δηλαδή, δε μιλά για εκθεσιακό χώρο.Η Εφορεία λέει πως "ο Δήμος Μουζακίου έχει παραχωρήσει ένα ημιτελές κτιριακό συγκρότημα, για το οποίο θα διαμορφωθεί η τελική πρόταση" και καταλήγει σημειώνοντας ότι "ο αρχαιολογικός χώρος της Κοινότητας Γόμφων και η ευρύτερη περιοχή στερείται φύλακα αρχαιοτήτων" και επειδή "την τελευταία δεκαετία έχουν διενεργηθεί επανειλημμένα λαθρανασκαφές και καταστροφές από αρχαιοκάπηλους, επιβάλλεται η φύλαξη και η προστασία του χώρου με φυλακτικό προσωπικό".

Κατά τ' άλλα η Εφορεία παρουσιάζει τον αρχαιολογικό χώρο των αρχαίων Γόμφων, στη θέση "Επισκοπή" του Δήμου Μουζακίου, ενημερώνοντας ότι "στον ευρύτερο χώρο πραγματοποιούνται σωστικές ανασκαφές από δεκαμελές έμπειρο εργατοτεχνικό προσωπικό". Ενημερώνει, ακόμη, ότι έχει γίνει καθαρισμός του τείχους, κατασκευασμένο από πλίνθους πωρολίθου, ενώ σε ανασκαφές στην αρχαία πόλη αποκαλύφθηκαν "τμήμα μεγάλου δημόσιου κτιρίου και δρόμου των ύστερων ελληνιστικών χρόνων, τμήμα μεγάλου κτιρίου από δόμους ασβεστόλιθου με βάσεις αναθημάτων, μαρμάρινη προτομή αυτοκρατορικών ρωμαϊκών χρόνων, σπόνδυλοι κιόνων και μαρμάρινη λάρνακα νεοαττικού τύπου. Στην κοίτη του Πάμισου ποταμού αποκαλύφθηκαν ελληνιστικοί και ρωμαϊκοί τάφοι καθώς και τμήμα βάθρου υστερορωμαϊκής γέφυρας".

Η γεωλογική ιστορία της λεκάνης του Αιγαίου τα τελευταία 20 εκατομμύρια χρόνια, η χλωρίδα,οι οικολογικές συνθήκες,το κλίμα και οι μεταβολές του, η ηφαιστειακή δραστηριότητα, καθώς και οι μεγάλες τεκτονικές κινήσεις, που διαμόρφωσαν τη σημερινή δομή της περιοχής, είναι πληροφορίες που αποτυπώνονται στο Απολιθωμένο Δάσος της Λέσβου.

Φέτος, για πρώτη φορά, το Μουσείο Φυσικής Ιστορίας Απολιθωμένου Δάσους Λέσβου πραγματοποίησε ανασκαφές στην περιοχή, σε συνεργασία με τη Διεύθυνση Δασών Λέσβου, με σκοπό όχι μόνο τη συλλογή νέων στοιχείων, αλλά και τον εμπλουτισμό των συλλογών του Μουσείου, που σύντομα θα εκτεθούν στις συλλογές του νέου κτιρίου.

Ο κύριος όγκος των ανασκαφών διεξάγονται στη θέση "Μπαλή Αλώνια" και μέχρι σήμερα έχει αποκαλυφθεί μεγάλος αριθμός φυτικών απολιθωμάτων.Ανάμεσά τους, ένας ιστάμενος κορμός απολιθωμένου δέντρου,που αποτελεί ένα από τα μεγαλύτερα διασωζόμενα φυτικά απολιθώματα στον κόσμο,αφού το ύψος του φτάνει τα 7,2 μέτρα και η περίμετρός του τα 8,58 μέτρα.Κι ακόμα δύο ιστάμενοι απολιθωμένοι κορμοί κωνοφόρων δέντρων,που ανήκουν πιθανώς στην οικογένεια των Πρωτοπευκιδών,ένας ιστάμενος κορμός με εντυπωσιακά πορφυρά χρώματα και άριστη διατήρηση των μορφολογικών γνωρισμάτων και της δομής του ξύλου κ.ά.

Εντυπωσιακά είναι και τα τμήματα των φυτών (καρποί, φύλλα, κλαδιά, ρίζες), που διατηρήθηκαν μέχρι σήμερα, προφυλαγμένα μέσα στα ηφαιστειακά υλικά, αλλά που, μετά την αποκάλυψή τους, κινδυνεύουν κατά την παραμονή τους στον υπαίθριο χώρο από διάβρωση, καταστροφή ή ακόμα και κλοπή.

Τα πρώτα ευρήματα των ανασκαφών οδηγούν στο συμπέρασμα ότι η περιοχή βρίσκεται στο ψηλότερο σημείο ενός μεικτού δάσους κωνοφόρων δέντρων, πρόδρομη μορφή του σημερινού είδους Σεκόια η αειθαλής.Οι ειδικοί επιστήμονες πιστεύουν ότι συγκρίσιμο οικοσύστημα με αυτό του Απολιθωμένου Δάσους αποτελούν τα δάση των κωνοφόρων, που συναντώνται σήμερα στη Βόρειο Αμερική.

Τα ευρήματα και συμπεράσματα των ανασκαφών, οι οποίες διευθύνονται από τον διευθυντή του Μουσείου, δρ. Ν. Ζούρο και τον καθηγητή Παλαιοβοτανικής, Ε. Βελιτζέλο,θα παρουσιαστούν σε διεθνές επιστημονικό συνέδριο τον προσεχή Μάη.