Πλήρως αυτονομημένο Ιδρυμα με εκλεγμένες πρυτανικές αρχές είναι - επιτέλους - από προχτές το Ιόνιο Πανεπιστήμιο. Στις πρυτανικές εκλογές που διενεργήθηκαν εκλέχτηκε πρύτανης ο Δημήτρης Τσουγκαράκης, πρόεδρος του Τμήματος Ιστορίας και αντιπρυτάνεις ο Βασίλης Χρυσικόπουλος, πρόεδρος του Τμήματος Αρχειονομίας και Βιλιοθηκονομίας και ο Χάρης Ξανθουδάκης, πρόεδρος του Τμήματος Μουσικών Σπουδών.