Με την πλειονότητα των αγώνων της δεύτερης φάσης, ξεκίνησε το Σαββατοκύριακο ο θεσμός του Κυπέλλου. Στη συγκεκριμένη φάση αγωνίζονται μόνο ομάδες της Γ' Εθνικής, οι οποίες κοντράρονται μεταξύ τους σε μονούς αγώνες, με τους νικητές να εξασφαλίζουν άμεσα την πρόκριση. Τα αποτελέσματα ήταν: Λαμία-Εθνικός 1-2, Αχαϊκή-Αστέρας Τρίπολης 1-2, Παναιτωλικός-Αιολικός 6-7 στα πέναλτι (κ.α.: 1-1), ΠΑΣ Γιάννινα-Απόλλων 3-0, Λήλας-Πανθρακικός 2-4 στα πέναλτι (κ.α. 0-0, παρ. 1-1), Πιερικός-Μεσσηνιακός 3-0, Αναγέννηση Αρτας-Αχαρναϊκός 2-1, Τρίκαλα-Κοζάνη 2-1, Πτολεμαΐδα-Αναγέν. Καρδίτσας 0-1, Κερατσίνι-Δόξα Δράμας 0-0 (2-4 στα πέναλτι), ΑΕ Γιάννενα-Ενωση Θράκης 1-4, Θύελλα Πατρών-Ιωνία Χανίων 4-1, Αγροτ. Αστέρας-Βύζας Μεγάρων 6-2.