Οπως η ηλεκτροφόρηση, η εύρεση της γονιδιακής ακολουθίας με την τεχνική των νανοπόρων χρησιμοποιεί την ηλεκτρική έλξη του DNA προς ένα θετικό φορτίο. Για να φτάσει εκεί, το μόριο πρέπει να περάσει μέσα από μια μεμβράνη, της οποίας το στενότερο σημείο είναι 1,5 νανόμετρο (δισεκατομμυριοστό του μέτρου). Αυτή η διάμετρος επιτρέπει τη διέλευση μόνο στις μονές αλυσίδες DNA. Καθώς το «νήμα» διέρχεται τον πόρο, τα νουκλεοτίδια φράζουν στιγμιαία το άνοιγμα, αλλάζοντας την αγωγιμότητα της κυτταρικής μεμβράνης. Οι διαφορές των μορίων των τεσσάρων τύπων βάσεων προκαλούν διαφορετικής διάρκειας και αποτελεσματικότητας απόφραξη του πόρου. Προς το παρόν, με ακρίβεια μπορούν να ανιχνευτούν μόνο οι διαφορές αγωγιμότητας που οφείλονται σε αλυσίδες 150 νουκλεοτιδίων του ίδιου τύπου. Η βελτίωση της μεθόδου, έτσι ώστε να μπορεί να ανιχνεύεται καθένα από τα νουκλεοτίδια μιας αλυσίδας DNA, θα οδηγούσε στην απευθείας μετάφραση του διαγράμματος αγωγιμότητας σε ακολουθία νουκλεοτιδίων. Με τελειοποιημένη την τεχνική αυτή, το γονιδίωμα ενός ανθρώπου θα μπορούσε να «διαβαστεί» μέσα σε μόλις 20 λεπτά, χωρίς την πολυδάπανη διαδικασία των βημάτων αντιγραφής της αλυσίδας DNA και των σχετικών χημικών αντιδράσεων.