Στην επιλογή των Ενδιάμεσων Φορέων, στόχος των οποίων είναι η υποστήριξη της Ειδικής Υπηρεσίας Διαχείρισης του υπουργείου Ανάπτυξης για το πρόγραμμα της Ανταγωνιστικότητας, προχώρησε το αρμόδιο υπουργείο.. Οι Ενδιάμεσοι Φορείς ανά περιοχή είναι οι εξής:

1) Ανατολική Μακεδονία και Θράκη: ΔΕΣΜΟΣ ΛΜΘ με συνεργαζόμενη τράπεζα την ALPHA

2) Δυτική Ελλάδα, Ηπειρος, Ιόνια, Πελοπόννησος: ΕΤΑΙΡΙΑ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗΣ ΚΟΙΝΟΤΙΚΩΝ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΩΝ με συνεργαζόμενη τράπεζα την Πειραιώς.

3) Αττική, Βόρειο και Νότιο Αιγαίο: ΕΛΛΑΝΕΤ, συνεργαζόμενες τράπεζες την Alpha και την Εθνική

4) Κεντρική και Δυτική Μακεδονία: ΚΕΠΑ - ΑΝΕΜ με συνεργαζόμενη τράπεζα την Εγνατία

5) Κρήτη: ΑΝΑΠΤΥΞΙΑΚΗ ΚΡΗΤΗΣ με συνεργαζόμενες Τράπεζες την Παγκρήτια Συνεταιριστική Τράπεζα και τη Συνεταιριστική Τράπεζα Χανίων.

6) Αιολικά Πάρκα Ευβοίας, Λακωνίας, Ν. Αρκαδίας: ΚΑΠΕ με συνεργαζόμενη τράπεζα την Εθνική.