Η διαιτησία είναι κάτι που απασχολεί όλους σε αυτό το Μουντιάλ. Τα «φαλτσοσφυρίγματα» των ρέφερι, που μάλιστα φέτος ξεφεύγουν από τον συνηθισμένο τρόπο (υπέρ των φαβορί), προσπάθησαν να τα ερμηνεύσουν πολλοί με διάφορα σενάρια, ακόμα και με συσχετισμό των πρόσφατων εκλογών στην παγκόσμια συνομοσπονδία και την εκλογή Μπλάτερ. Πάντως, όπως και να έχουν τα πράγματα, και η ίδια η ΦΙΦΑ δε φαίνεται να κρατάει τα προσχήματα. Τελευταίο παράδειγμα το κόψιμο του Ελληνα διαιτητή Κύρου Βασάρα από τη συνέχεια της διοργάνωσης. Ο Ελληνας διεθνής διαιτητής, παρά το γεγονός ότι είχε άψογη διαιτησία στο μοναδικό παιχνίδι που διαιτήτευσε μεταξύ της Κίνας και της Κόστα Ρίκα, βρέθηκε ανεξήγητα στην... παρέα των ρέφερι που η διαιτησία τους ήταν σχολιάσιμη και έτσι αποχαιρετάει τη φετινή διοργάνωση. Μεταξύ των διαιτητών που κόπηκαν ήταν ο Αγγλος Γκράχαμ Πολ (Κροατία-Ιταλία), ο Ανχελ Σάντσες (Ν. Κορέα-Πορτογαλία), Πέτερ Πρέντεργκαστ (Βραζιλία-Βέλγιο), Μπάιρον Μορένο (Ν. Κορέα-Ιταλία) και Γιουνγκ Γιο Κιμ (Βραζιλία-Τουρκία).

Αναλυτικά οι 16 διαιτητές που επέλεξε η ΦΙΦΑ: Αλί Μπουσαΐμ (ΗΑΕ), Κόφι Κοντία (Μπενίν), Πιερλουίτζι Κολίνα (Ιταλία), Χιου Ντάλας (Σκοτία), Αντερς Φρισκ (Σουηδία), Γκαμάλ Γκαντούρ (Αίγυπτος), Μπράιαν Χολ (ΗΠΑ), Σάαντ Μάνε (Κουβέιτ), Ουρς Μέιερ (Ελβετία), Μάρκους Μερκ (Γερμανία), Κιμ Μίλτον Νίλσεν (Δανία), Φελίπε Ράμος Ρίζο (Μεξικό), Οσκαρ Ρουίς (Κολομβία), Μαρκ Σιλντ (Αυστραλία), Κάρλος Σιμόν (Βραζιλία), Ζιλ Βεϊσιέρ (Γαλλία). Οσον αφορά τους βοηθούς διαιτητών, οι 16 που συνεχίζουν είναι οι εξής: Αλι Αλ Τραϊφί (Σαουδ. Αραβία), Εβζέν Αμλέρ (Τσεχία), Φρεντερίκ Αρνό (Γαλλία), Ντραμανέ Νταντέ (Μάλι), Μιγκέλ Τζιακομούτσι (Παραγουάη), Βισβά Κρίσναν (Σιγκαπούρη), Λιφ Λίντμπεργκ (Σουηδία), Χάινερ Μίλερ (Γερμανία), Μάικλ Ράγκουναθ (Τρίνινταντ & Τομπάγκο), Χόρχε Ραταλίνο (Αργεντινή), Μοχάμεντ Σαέεντ (Μαλβίδες), Φίλιπ Σαρπ (Αγγλία), Ιγκόρ Σράμκα (Σλοβακία), Αλί Τομουσάνγκε (Ουγκάντα), Εκτορ Βέργκαρα (Καναδάς), Ματσέι Βιερμπόβσκι (Πολωνία).