«Τσακωμένος» με την... τύχη φαίνεται πως ήταν και φέτος ο Παναθηναϊκός. Στην κλήρωση της ευρωλίγκας είχε τη χειρότερη αντιμετώπιση, συγκριτικά με τις άλλες δύο ελληνικές ομάδας. Κληρώθηκε στον δεύτερο όμιλο, με επικεφαλής την ΤΣΣΚΑ Μόσχας και τις Μακάμπι Τελ Αβίβ (οικοδέσποινα του φάιναλ φορ), Μάλαγα, Σκίπερ Μπολόνια, Ζαλγκίρις Κάουνας, Βίρτους Μπολόνια, Κρκα Νόβο Μέστο. Λιγότερο άσχημη, πάντως όχι εύκολη, είναι και η αποστολή του Ολυμπιακού. Στα πλαίσια του τρίτου ομίλου, καλείται να αντιμετωπίσει τις Μπενετόν Τρεβίζο, ΤΑU, Βαλένθια, Εφές Πίλσεν, Σλασκ Βρότσλαβ, Αλμπα Βερολίνου, Βιλερμπάν. Οσο για την ΑΕΚ ήταν μάλλον η πιο ευνοημένη αφού στο πρώτο όμιλο θα συναντηθεί μεν με την Πρωταθλήτρια Ευρώπης Μπαρτσελόνα αλλά υπάρχουν επίσης και οι Ρόμα, Ούλκερ, Ολύμπια Λιουμπλιάνα, Ορτέζ, Τσιμπόνα, Παρτιζάν.

Από κάθε όμιλο προκρίνονται οι πέντε πρώτοι, ενώ στη φάση των «16» μετέχει και ο καλύτερος έκτος των τριών ομίλων. Στη δεύτερη φάση δημιουργούνται (μετά από νέα κλήρωση) τέσσερις όμιλοι των τεσσάρων και οι τέσσερις πρώτοι από κάθε γκρουπ περνάνε στο φάιναλ φορ. Η κανονική περίοδος ξεκινάει στις 5/11/2003 και ολοκληρώνεται (σε 14 αγωνιστικές) στις 19/2/2004. Η δεύτερη φάση (top-16) θα γίνει (σε έξι αγωνιστικές) από 3/3/2004 έως 8/4/2004 ενώ το φάιναλ φορ θα φιλοξενηθεί στο Τελ Αβίβ και στο «Γιαντ Ελιάου» από 29 Απριλίου έως 1 Μαΐου του 2004.