Αντίθετοι σε αρκετά από όσα προβλέπει το πολυνομοσχέδιο για την πολιτική, την ποινική και διοικητική δίκη είναι η Ολομέλεια του Αρείου Πάγου που συνήλθε υπό την πρόεδρο Ρ. Ασημακοπούλου, καθώς και η Ολομέλεια της Εισαγγελίας του Ανωτάτου Δικαστηρίου υπό τον εισαγγελέα Ι. Τέντε. Οι Ολομέλειες ζητούν τη μείωση παραβόλων από 300 σε 200 ευρώ σε διάφορες διαδικασίες, όπως στην προσφυγή σε εισαγγελέα εφετών στην περίπτωση που αρχειοθετείται η έγκληση. Σχετικά με ίδρυση Μονομελών Εφετείων η Ολομέλεια διαφωνεί κατά πλειοψηφία, ενώ η Ολομέλεια της Εισαγγελίας τα αποδέχεται ως λύση ανάγκης, υπό την προϋπόθεση να βρεθούν αίθουσες και να επιλεγούν στα Μονομελή Εφετεία οι καλύτεροι των δικαστών. Και οι δύο Ολομέλειες θεωρούν ότι δεν μπορούν να εφαρμοστούν οι διατάξεις που προβλέπουν σε περίπτωση αποχής των δικηγόρων την αναβολή υποθέσεων και εκδίκασή τους εντός 90 ημερών.

Για την αύξηση των ποσών που το πολυνομοσχέδιο καθορίζει σε διάφορες περιπτώσεις τις κακουργηματικές πράξεις (από 15.000 σε 60.000 ευρώ, από 73.000 σε 300.000 ευρώ κ.λπ.) οι Ολομέλειες εκτιμούν ότι υπάρχει κίνδυνος παραγραφής παρά τη ρύθμιση του υπουργείου ότι δεν αφορά τις εκκρεμείς υποθέσεις, γιατί με νεότερες υπερνομοθετικές διατάξεις (Χάρτης της Ευρωπαϊκής Ενωσης για ανθρώπινα δικαιώματα) πρέπει να εφαρμόζονται οι ευνοϊκότεροι νόμοι. Τέλος, οι Ολομέλειες διαφωνούν με την πταισματοποίηση διάφορων αδικημάτων που ήταν πλημμελήματα, όπως σωματικές βλάβες, εξύβριση κ.ά., ενώ η Ολομέλεια του Αρείου Πάγου διαφωνεί με την πταισματοποίηση της δυσφήμισης.