Δεν μπορούν οι νομάρχες να εγκρίνουν ή να απορρίπτουν τις γνωμοδοτήσεις του Νομαρχιακού Συμβουλίου που αφορούν την ίδρυση, κατάργηση, συγχώνευση, διαίρεση και μεταφορά σχολικών μονάδων. Η αρμοδιότητα αυτή θα πρέπει να παραμείνει στο υπουργείο Παιδείας, σύμφωνα με απόφαση του Συμβουλίου της Επικρατείας (234/2000).
Συγκεκριμένα, το Ανώτατο Διοικητικό Δικαστήριο έκρινε αντισυνταγματική τη διάταξη του Προεδρικού Διατάγματος που κατατέθηκε στο ΣτΕ και αφορούσε τη μεταφορά αρμοδιοτήτων από το υπουργείο Παιδείας στην Τοπική Αυτοδιοίκηση. Η παραπάνω αρμοδιότητα, κατά την άποψη του ΣτΕ, αφορά ουσιώδες ζητήματα στην ίδρυση και λειτουργία της εκπαίδευσης και δεν μπορεί να μεταβιβαστεί στους νομάρχες. Να υπενθυμίσουμε ότι και στο παρελθόν το Ανώτατο Διοικητικό Δικαστήριο έκρινε αντισυνταγματική τη διάταξη του νόμου για το δεύτερο βαθμό Τοπικής Αυτοδιοίκησης κατά το σκέλος που μεταφέρει ουσιαστικές αρμοδιότητες που αφορούν το χώρο της Παιδείας στην Τοπική Αυτοδιοίκηση.
Αντίθετα, το ΣτΕ έκρινε νόμιμες όλες τις άλλες αρμοδιότητες (είκοσι τέσσερις τον αριθμό) που μεταφέρονται, αρμοδιότητες ήσσονος σημασίας, από το υπουργείο Παιδείας στην Τοπική Αυτοδιοίκηση και αφορούν την πρωτοβάθμια και δευτεροβάθμια εκπαίδευση, καθώς και τα σχολεία της μέσης εκκλησιαστικής εκπαίδευσης, (όπως έγκριση σχολικών εκδρομών στο εσωτερικό και το εξωτερικό, την εποπτεία και τον έλεγχο των συλλόγων γονέων και κηδεμόνων, τη μίσθωση ακινήτων για τη στέγαση σχολικών μονάδων κλπ.).
Πάντως, μετά τις αντιδράσεις των νομαρχών που διαμαρτύρονταν για αφαίρεση αρμοδιοτήτων τους, ο υπουργός Παιδείας Π. Ευθυμίου με το Προεδρικό Διάταγμα επιχείρησε να «μπαλώσει» την κατάσταση και παραχώρησε κάποιες μικροαρμοδιότητες στην Τοπική Αυτοδιοίκηση.