Ζητήματα που άπτονται της οργάνωσης των ελέγχων που διενεργεί ο Ενιαίος Φορέας Ελέγχου Τροφίμων (ΕΦΕΤ) και των αρμοδιοτήτων μεταξύ των συναρμοδίων υπουργείων και υπηρεσιών με «οδηγό» σε κάθε περίπτωση τις ευρωπαϊκές ντιρεκτίβες αναδείχτηκαν στη διάρκεια των τεσσάρων συσκέψεων μεταξύ γεωτεχνικών και υπηρεσιακών παραγόντων. Σύμφωνα με την Πανελλήνια Ομοσπονδία Γεωτεχνικών Δημοσίων Υπαλλήλων (ΠΟΓΕΔΥ), στις συσκέψεις μεταξύ άλλων καταδείχτηκε ότι η σημερινή οργάνωση των επίσημων ελέγχων μέσω του ΕΦΕΤ δεν ανταποκρίνεται στις σύγχρονες ανάγκες, καθώς και η αναγκαιότητα ανάθεσης και διεξαγωγής των ελέγχων με διακριτούς ρόλους στα συναρμόδια υπουργεία. Οι εμπλεκόμενοι φορείς θα υποβάλλουν τα υπομνήματα με τις προτάσεις τους στους αρμόδιους υπουργούς, προκειμένου να ληφθούν οι σχετικές αποφάσεις. Η ΠΟΓΕΔΥ από την πλευρά της δεν παραλείπει να εκφράσει τη σπουδή της από τη μια για τη διασφάλιση της ασφάλειας των τροφίμων και από την άλλη για την κάλυψη των υποχρεώσεων της χώρας απέναντι στην ΕΕ και, όπως, σημειώνει, εάν οι προτάσεις των συναρμοδίων υπουργείων κινούνται σε διαφορετική κατεύθυνση, «θα αντιδράσει δυναμικά».