Σε ρυθμιστικό παράγοντα στη μεγαλύτερη κρίση της «Φατάχ» έχει αναδειχτεί ο Μαρουάν Μπαργκούτι. Ο ηγέτης της οργάνωσης στη Δυτική Οχθη, που συνελήφθη από τον ισραηλινό στρατό τον Απρίλη του 2002, και καταδικάστηκε σε πεντάκις ισόβια για εμπλοκή σε αντιισραηλινές επιθέσεις, κρατά το κλειδί για την «επόμενη μέρα», αποφασίζοντας αν θα επιμείνει στην κατάθεση ξεχωριστού ψηφοδελτίου στις επικείμενες βουλευτικές, για λογαριασμό της «Φατάχ».

Εχοντας αποσύρει, πέρυσι, την υποψηφιότητά του για διάδοχος του Γιάσερ Αραφάτ στα ηνία της οργάνωσης, ζητώντας, όμως, από τον Μαχμούντ Αμπάς ριζικές μεταρρυθμίσεις και ανάδειξη νέων προσώπων. Συνεργάτες του Μπαργκούτι διατείνονται ότι οι δεσμεύσεις δεν τηρήθηκαν.

Επιπλέον, η λεγόμενη παλαιά φρουρά της «Φατάχ» αποφάσισε να μην κατακυρώσει τα αποτελέσματα των εσωκομματικών εκλογών, που ανέδειξαν τους υποψηφίους για τις επικείμενες βουλευτικές εκλογές, επειδή, όπως την κατηγορούν, είδε ότι η «νέα γενιά» κέρδιζε την εμπιστοσύνη των μελών. Ο Μπαργκούτι και οι συνεργάτες του κατηγορούν την παραδοσιακή ηγεσία της οργάνωσης ότι έχει δεχτεί ανεπανόρθωτο πλήγμα από τη φθορά της εξουσίας και τις καταγγελίες για διαφθορά, ενώ υποστηρίζουν ότι έχει απομακρυνθεί πολύ από τους απλούς πολίτες και τις ανάγκες τους, γεγονός που δίνει προβάδισμα στη «Χαμάς».

Αν και ο ίδιος το αρνείται, οι «Ταξιαρχίες του αλ Ακσα» τον χαρακτηρίζουν ηγέτη τους. Από την πλευρά του, ήταν επιφυλακτικός ως προς τις δυνατότητες επιτυχίας της Συμφωνίας του Οσλο, τάχθηκε υπέρ της ένοπλης αντίστασης στην κατοχή, καταδικάζοντας, όμως, τις επιθέσεις αυτοκτονίας.