Μικρά προβλήματα παρουσιάστηκαν στην εκλογική διαδικασία, σε ορισμένα εκλογικά τμήματα.

Συγκεκριμένα, σε τρία εκλογικά τμήματα (207ο Πύργου Ηλείας, 28ο στα Αμπελάκια Σαλαμίνας και ένα στο Αιγάλεω) δεν παρουσιάστηκε στην καθορισμένη ώρα δικαστικός αντιπρόσωπος. Αργότερα, διορίστηκε αναπληρωτής και η διαδικασία ξεκίνησε κανονικά.

Επίσης, σε πολλά εκλογικά τμήματα δεν παρουσιάστηκαν όλα τα μέλη των εφορευτικών επιτροπών. Οπως στο 23ο εκλογικό τμήμα Αθηνών, όπου και επρόκειτο να ψηφίσει ο πρωθυπουργός. Πάντως, ο δικαστικός αντιπρόσωπος δήλωσε ότι και μόνος του θα μπορούσε να συντονίσει τη διαδικασία και η ψηφοφορία συνεχίστηκε.

Εξάλλου, στο χωριό Κανδύλα Αρκαδίας, πολλοί κάτοικοι απείχαν επειδή εδώ και 15 χρόνια δεν έχει γίνει αναδασμός στην περιοχή τους. Σε αποχή από την ψηφοφορία προχώρησαν και πολλοί κάτοικοι από την Αγία Παρασκευή Κόνιτσας στην Ηπειρο και από το Πολυμέρι Τρικάλων, καθώς αντιδρούν με τις αναγκαστικές συνενώσεις του "Καποδίστρια".